巨噬细胞（Macrophages）是一种位于组织内的白血球，源自单核细胞，而单核细胞又来源于骨髓中的前体细胞。巨噬细胞和单核细胞皆为吞噬细胞，在脊椎动物体内参与非特异性防卫（先天性免疫）和特异性防卫（细胞免疫）。它们的主要功能是以固定细胞或游离细胞的形式对细胞残片及病原体进行噬菌作用（即吞噬以及消化），并激活淋巴球或其他免疫细胞，令其对病原体作出反应。巨噬细胞属免疫细胞，有多种功能，是研究细胞吞噬、细胞免疫和分子免疫学的重要对象。巨噬细胞容易获得，便于培养，并可进行纯化。巨噬细胞属不繁殖细胞群，在条件适宜下可生活2-3周，多用做原代培养，难以长期生存。
巨噬细胞的表型
巨噬细胞作为炎症反应的主要作用细胞，在不同条件下，有着明显的形态和功能差异。通过表型分析鉴定巨噬细胞类型可以更好的研究巨噬细胞的功能多样性。
根据巨噬细胞的活化状态、功能差异以及分泌因子的区别，巨噬细胞可以分为经典活化巨噬细胞（M1型）和选择性活化巨噬细胞（M2型）。
M1型巨噬细胞通常是通过IFN-γ以及细菌脂多糖（LPS）进行活化，主要分泌促炎症因子（IL-12, IL-23, 活化的细胞可产生iNOS，炎性细胞因子（TNF, IL-6, IL-12, IL-15）在Th1反应中成为诱导性及效应性细胞。在IFN-γ刺激下，iNOS, CD16/32, MHC-II, CD40, CD80, CD86及B7等分子的表达量会上调），趋化因子为：CXCL1、2、3、5、8、9、10及CCL2、3、4、5、11、17。在炎症早期承担着重要角色，起着促炎反应的作用。
M2型巨噬细胞通过Th2细胞因子（IL-4, IL-13）及免疫复合物（IL-10）进行激活，高表达清道夫受体CD163，甘露糖受体CD206，半乳糖型受体，IL-10, IL-8, 单核细胞趋化蛋白-1（MCP-1），干扰素诱导蛋白10（IP-10），巨噬细胞炎性蛋白（MIP-1）等抑制炎症因子，趋化因子为抑制I型巨噬细胞产生促炎性趋化因子，诱导自身产生于Th2反应相关的趋化因子，如CCL24，CCL17，CCL22，CCL2等，起着抑制炎症反应以及组织修复的作用。
M2型巨噬细胞又可以分为三种亚型，分别为M2a, M2b, M2c。其中M2a, M2b发挥免疫调节作用及促进II型免疫反应，而M2c有抑制免疫反应及组织重构的作用。
不同组织或细胞的巨噬细胞marker
