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发布日期:2023/9/8 19:28:00

肝母细胞瘤(hepatoblastoma)是一种罕见但严重的儿童肿瘤,它通常在幼儿期(< 3岁)出现,并且是儿童恶性肿瘤中最常见的类型之一 [1]。目前,多种治疗方法,包括手术切除、化疗、放疗以及部分患者可能需要肝移植,被用于治疗肝母细胞瘤。然而,由于肝母细胞瘤的异质性以及个体间的遗传变异,寻找更精准的治疗方法迫切需要更深入的研究。近年来,单细胞测序技术的发展为研究肿瘤的细胞异质性和发病机制提供了新的途径。通过单细胞测序,可以深入了解肝肿瘤中不同细胞类型的差异,识别潜在的靶向治疗标志物,并揭示细胞间相互作用的复杂网络 [2]。然而由于单细胞测序需要大量来源于目标组织的高活性(活率80%以上)的单细胞,并且期望获得的细胞类型尽可能贴近原有组织的丰富程度。当前的肝肿瘤解离方法获得的单细胞悬液会导致肝实质细胞缺失、整体活率低。而实际研究中肝实质细胞在肝肿瘤的演进中起举足轻重的作用,因此保持细胞比例接近真实体内环境对于研究疾病靶点和指导临床用药十分重要。该文章提出基于多步酶解和Percoll密度梯度离心分离技术的单细胞分离方案,将免疫细胞和肝实质细胞分离处理,提高了细胞的存活率和活性并通过单细胞测序进行了验证。通过这种方法,能够更精确地还原肝脏组织中不同细胞类型的比例,为单细胞测序提供了优质的样本,有望加速肝肿瘤相关研究的进展。

 
 
该实验方法首先利用了分步酶解策略,将酶解过程分为多个步骤,从而减少单细胞在裂解液中的存在时间,提高细胞的存活率。同时,根据肝实质细胞较为脆弱的情况,使用了Percoll密度梯度离心的方法对肝实质细胞进行了分离,该步骤分离的另一个产物为包含红细胞的免疫细胞沉淀,因此仅对该部分进行红细胞裂解也进一步为肝实质细胞的活性以及单细胞测序样本的质量提供了保障。除了肝组织单细胞悬液制备的详细试剂盒方法外,本方案也提供了单细胞转录组建库测序和数据分析的初步指南。
 
图1 肝母细胞瘤单细胞悬液制备及单细胞分析流程图
 
在本实验流程中,研究者还详细地展示了肝母细胞瘤样本的数据质控和注释方法,并获得了包含Immune cell、Endothelial cell、Stromal cell以及Tissue specific cell四个大类、超20个细胞亚群的高质量单细胞分群结果,从数据角度显示出该方法所得单细胞悬液的高活性和细胞类型全面性。
 
 
文章结论与讨论,启发与展望

综上所示,该论文系统性介绍了肝母细胞瘤组织的单细胞悬液制备和单细胞转录组测序及分析的详细流程,所得单细胞悬液具有活性高、细胞类型丰富、细胞得率高等特点,不仅使为单细胞测序提供了高质量的样本,简便的步骤还能够节约时间和耗材成本,具有良好的实际应用价值。同时,该研究方案提供了实验所以详细试剂耗材,并例举了操作过程中的注意事项及常见问题解决方案,为后续使用提供了便利。同时对于其他疾病的肝脏样本,该实验方案也具有推广应用价值。

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