猪流感是由 H1N1 病毒引起的流感变种。该病毒株于 2009 年 6 月至 2010 年 8 月期间在全球范围内引起感染传播。世界卫生组织在2009年宣布猪流感为大流行病。该病毒已从猪传染给人类，并迅速传播。
它是甲型流感病毒的一个亚型。甲型流感可在人类、鸟类、猪和其他一些哺乳动物中引起流感。该病毒会引起咳嗽、高烧、头痛、流鼻涕、关节和肌肉疼痛等症状。其学术名称为 (H1N1)pdm09 病毒。
近日，美国密歇根大学写研究团队发现pdm09 毒株在人类与猪之间杂交了约 370 次。这些发现进一步证明，控制与猪打交道的人感染甲型流感有助于防止病毒传播给猪，并降低病毒传播给人类的风险。该研究题为“Reverse-zoonoses of 2009 H1N1 pandemic influenza A viruses and evolution in United States swine results in viruses with zoonotic potential”，发表在PLOS杂志。
甲型流感病毒 (IAV) 在人与猪之间的传播增加了猪 IAV 的遗传和抗原多样性，扰乱了控制工作并影响了动物健康。人与猪 IAV 界面重要性的典型例子是 2009 年 H1N1 大流行：这种 HA 谱系于 1900 年代初在猪中建立，与 1918 年人类 IAV 大流行同时发生，在猪宿主中进化了 90 多年，随后引起了21世纪第一次IAV大流行。
pdm09病毒是一种重配病毒，其基因片段源自禽类、人类和猪宿主；每个基因片段在猪体内进化了不同的持续时间，数据表明该病毒在成为大流行之前已经在猪体内存在了约5-10 年。这种多重重配病毒适应了人类宿主，现在是人类季节性 H1N1，具有季节性流行高峰和传播。
在这项研究中，作者调查了 H1N1pdm09 谱系的种间传播。作者了解了在 COVID-19 大流行期间观察到的 2020-21 年人类流感季节 IAV 流通是否减少 ，影响了猪 pdm09 谱系的进化以及这如何影响其人畜共患潜力。
H1N1 流感大流行谱系的人传猪现象频繁发生
作者推断了 2009 年至 2021 年间在美国测序的 13,935 个人类和猪 pdm09 HA 基因的祖先宿主状态。该分析估计，在 pdm09 出现并建立为 H1 人类季节性谱系后，pdm09 病毒在美国被从人类引入猪中约 370 次（其中 340 次溢出得到了高度统计支持）。
研究发现，H1 pdm09 相对于所有猪 H1 遗传进化枝的比例多年来相对一致，但在人群中 pdm09 负担较高的季节，该检测比例有增加的趋势。在美国 26 个拥有猪 pdm09 数据的州中，有 22 个州检测到了溢出效应，所有溢出效应的 17% 传播到了两个或更多州。大多数带有 pdm09 表面和内部基因的病毒似乎反映了人类传播和猪短暂传播。在 2019-20 季节，猪体内 40% 的 pdm09 具有完整的 pdm09 基因组，而在 2020-21 季节，这一比例下降至 7.3%，当时没有额外的人与猪之间的传播来维持完整 pdm09 的较高比例病毒。
猪中 pdm09 循环增加与人畜共患病检测相关
作者发现，A/North Carolina/01/2021 和 A/Iowa/01/2021 HA 在系统发育中嵌套在不同的猪 pdm09 进化枝中，并且这两个菌株与各自的猪分离基因的关系比与人类分离的基因的关系更密切。这两种人畜共患菌株均获得了 HA1 突变 G155E，该突变与与 α2,6 连接聚糖的结合以及 N129D 突变（两种分离株共有的突变）相关，并与抗原逃逸相关。。在该研究的数据集中，G155E 突变存在于 12% 的猪 pdm09 序列中，而仅存在于 0.2% 的人类序列中，它在病毒的整个进化过程中独立发生了76次，并且是人与猪之间传播后猪中与pdm09 HA基因相关的可重复的氨基酸变化。
总之，该研究表明，大多数人传猪的传播事件都是孤立的，但一些少数事件导致不同pdm09 遗传谱系在美国猪中持续循环。这些猪循环的变体似乎与人类季节性疫苗在遗传上匹配较差，这表明疫苗对它们的保护作用非常弱。分析还表明，猪群中持续存在的 pdm09 循环与至少5起猪-人类传播的病例有关。
这些发现进一步证明，控制与猪打交道的人感染甲型流感有助于防止病毒传播给猪，并降低病毒传播给人类的风险。科学家和政策制定者越来越认识到环境变化、人类活动以及传染病从动物到人类的传播之间的相互联系。
随着气候变化改变生态系统并影响动物物种的分布，未来几年人畜共患病爆发的可能性可能会增加。特别是自 COVID-19 大流行以来，人们也越来越认识到需要解决人畜共患疾病带来的复杂挑战。
